* Thomas et ses amis, Minho, Newt et Teresa, échappent enfin au redoutable labyrinthe.
* Ils apprennent la vérité sur leur véritable objectif :servir de sujets dans une expérience cruelle menée par WCKD, l'organisation qui a créé et contrôlé le labyrinthe.
* Teresa révèle son allégeance à WCKD, laissant Thomas le cœur brisé et se demandant à qui il peut faire confiance.
* Le groupe, désormais fugitif, se lance dans un dangereux voyage à travers le Scorch, un désert désolé et traître, à la recherche du mythique Safe Haven, un endroit où ils peuvent se libérer des griffes de WCKD.
* En cours de route, ils font face à de nombreux défis, notamment des Cranks impitoyables, de violentes tempêtes et la menace omniprésente des Créateurs.
* Finalement, ils atteignent Safe Haven, pour découvrir que ce n'est pas ce qu'ils avaient espéré. Il s'agit d'un refuge temporaire, contrôlé par une autre faction qui cherche également à les exploiter à ses propres fins.
* Thomas, Minho et Newt apprennent la vérité sur la Flare, la maladie mortelle qui a ravagé le monde. Ils se rendent compte qu’ils détiennent la clé pour trouver un remède, grâce à leurs immunités uniques.
* Avec une détermination retrouvée, ils décident d'affronter WCKD et de mettre fin une fois pour toutes à leur règne de terreur. Ils se lancent dans une dernière mission, infiltrant le siège du WCKD pour révéler les secrets de l'organisation et libérer ceux qui ont été emprisonnés et expérimentés.
* Dans une bataille climatique, Thomas et ses amis surmontent de nombreux obstacles, affrontant leurs peurs les plus profondes et tout sacrifiant pour le plus grand bien de l'humanité.
* En fin de compte, ils réussissent leur mission, en faisant tomber le WCKD et en garantissant un avenir où les gens pourront vivre libres des griffes de la manipulation et de l'oppression.