L'histoire commence avec Ben recevant un indice sous la forme d'un médaillon vintage avec un message cryptique. Cela le conduit dans une aventure globe-trotter à travers l'Europe, où il doit déchiffrer les artefacts historiques et trouver la clé du coffre caché des francs-maçons.
En cours de route, il est rejoint par son partenaire Riley Poole et son père, Patrick Gates, qui s'implique à contrecœur dans la recherche. Ils sont confrontés à une opposition constante d'Ian Howe, un chasseur de trésors rival qui cherche le même prix, et une femme ruse et mystérieuse nommée Abigail, qui prétend avoir ses propres raisons de chercher le trésor.
Le voyage les emmène dans des endroits comme Londres, Paris et la Grande Muraille de Chine, alors qu'ils démêlent des indices cachés dans des documents historiques et des monuments. Le film présente un point culminant passionnant, où Ben doit courir contre le temps pour trouver le trésor et effacer le nom de son père.
En fin de compte, "National Treasure:Book of Secrets" est une aventure amusante et pleine d'action qui mélange l'intrigue historique avec l'humour et le cœur. Il continue l'héritage du premier film, offrant un mystère captivant qui maintient les téléspectateurs engagés jusqu'à la fin.