Livres :
- Faire l'histoire :un manuel de recherche historique (2001)
- Une brève histoire de la pensée catholique (2002)
- Protestantisme :une très courte introduction (2006)
- Comment lire les Pères de l'Église (2010)
- L'essence du christianisme (2012)
- Philosophie :une brève histoire (2014)
- La vision chrétienne de la nature humaine (2016)
- La philosophie de la religion :un manuel de cours (2017)
- The Oxford Handbook of Early Christian Studies (2019, édité avec Hugh Denard)
- L'Esprit de la Réforme (2021)
Articles et contributions :
- "Le rôle de l'Église dans l'humanisme chrétien" dans The Cambridge Companion to Christian Humanism (2009)
- « La pensée catholique et le monde moderne » dans The Wiley-Blackwell Companion to Catholicism (2010)
- "Le développement du droit naturel dans la pensée chrétienne" dans The Oxford Handbook of Natural Law (2011)
- "Thomas d'Aquin sur la foi et la raison" dans The Stanford Encyclopedia of Philosophy (2014)
- "L'héritage des scolastiques" dans The Routledge Companion to the History of Philosophy (2015)
En plus de ses livres, Troeger a rédigé des articles et des chapitres dans diverses revues universitaires et édité des volumes, explorant l'histoire du christianisme, les thèmes théologiques et l'intersection de la philosophie et de la religion.