Voici quelques exemples clés :
* La pierre philosophale : Le conflit central tourne autour de la menace de Lord Voldemort tentant de voler la Pierre pour retrouver son pouvoir.
* La Forêt Interdite : Ils font face au danger d'un chien à trois têtes gardant la Pierre et de diverses autres créatures.
* Le jeu d'échecs : Ils doivent surmonter un échiquier géant dont les pièces sont grandeur nature et dangereuses.
* Les trappes : Ils rencontrent de nombreux pièges dans le château, dont le fameux « piège du diable ».
* Le miroir du Riséd : Le Miroir du Erisé (le désir épelé à l'envers) tente Harry avec l'image de ses parents, ce qui lui fait presque perdre sa concentration sur la véritable tâche à accomplir.
* Professeur Quirrell : Ils découvrent que le professeur Quirrell, apparemment inoffensif, est en réalité possédé par Voldemort.
* La confrontation finale : Harry affronte Quirrell et Voldemort, risquant sa propre vie pour protéger la Pierre.
Ce ne sont là que quelques exemples des nombreux problèmes auxquels ils ont été confrontés. Tout au long du livre, Harry, Ron et Hermione font preuve de courage, d'ingéniosité et de loyauté pour surmonter ces obstacles.