Après la mort de leurs parents dans un incendie mystérieux, les enfants sont confiés à leur parent éloigné et sinistre, le comte Olaf. Olaf, un méchant rusé et méchant, poursuit sans relâche l'immense fortune des orphelins, complotant pour mettre la main dessus. Il se déguise et utilise divers stratagèmes pour kidnapper, mettre en danger et manipuler les enfants Baudelaire.
La série suit le parcours déchirant des orphelins alors qu'ils tentent d'échapper aux griffes d'Olaf et de découvrir les secrets de la mort de leurs parents. Ils sont confrontés à un flux constant de situations périlleuses, allant de l'échouage sur une île avec un serpent venimeux à la vie avec un groupe d'acteurs de théâtre tout aussi fourbes qu'Olaf.
Tout au long de leurs aventures, Violet utilise son esprit inventif pour créer des gadgets et des solutions, Klaus utilise ses connaissances approfondies en lecture pour résoudre des énigmes et déchiffrer des indices, et Sunny, malgré son âge, est un bébé féroce et intelligent qui communique à travers un langage bébé unique.
La série est racontée par Lemony Snicket, un auteur qui tente d'avertir les lecteurs des événements malheureux qui se déroulent, en soulignant l'importance de l'espoir et de la résilience même face à la tragédie.
Le mystère global de la mort des parents Baudelaire est tissé tout au long de la série, avec des indices et des fausses pistes dispersés tout au long du chemin. La série explore les thèmes de la perte, de la résilience, de la famille et de l'importance de lutter contre l'injustice.
Malgré le sujet sombre, la série est empreinte d'humour et d'esprit, ce qui la rend à la fois divertissante et stimulante. Il met les jeunes lecteurs au défi d’affronter les complexités de la vie et de trouver l’espoir même dans les situations les plus sombres.