Cependant, l'antagoniste le plus important et le plus central est Loki , le frère adoptif de Thor et le principal moteur du conflit du film. Il orchestre l'invasion de la Terre, cherchant à conquérir et à gouverner la planète.
Alors que d'autres antagonistes comme les Chitauri (une armée extraterrestre) et les agents d'HYDRA jouent des rôles importants dans le film, Loki reste la force motrice et le principal antagoniste qui affronte directement les Avengers.