Il existe cependant quelques exceptions :
* Rival : Vous pouvez affronter votre rival plusieurs fois au cours du jeu, mais ces batailles font partie de la progression de l'histoire et ne sont pas facultatives.
* Animateurs de gymnase : Après avoir battu les Elite Four, vous pouvez affronter à nouveau tous les leaders de gymnase dans leurs gymnases respectifs.
* Elite Quatre et Champion : Après avoir battu l'Elite Four et le Champion, vous pouvez les affronter à nouveau à l'entrée de Victory Road.
Ainsi, même si vous ne pouvez pas affronter deux fois les mêmes entraîneurs aléatoires, vous pouvez rejouer les personnages importants de l'histoire principale après avoir terminé le jeu.