Le jeu n'a pas Exodia l'Interdit ni aucune de ses pièces comme cartes jouables. Exodia est un personnage populaire de l'anime et du manga *Yu-Gi-Oh!*, mais il n'a été introduit dans le jeu de cartes officiel que dans l'ensemble *Legend of Blue-Eyes White Dragon*, sorti après *Reshef of Destruction*.
Le jeu se concentre sur les cartes divines égyptiennes (Slifer le dragon céleste, Ra le puissant et Obelisk le tourmenteur), qui sont les principaux antagonistes du scénario *Reshef of Destruction*.