La calcédoine est la forme la plus courante de quartz cryptocristallin. Le terme « cryptocristallin » signifie que les cristaux formant le minéral sont si petits qu'ils ne sont pas reconnaissables à l'œil nu ni au microscope normal. Lorsqu’il est présent sous forme d’agrégat cryptocristallin sous forme fibreuse, il devient la pierre précieuse connue sous le nom de chrysoprase.
Le terme calcédoine est utilisé dans deux cas précis :d'abord, pour un type spécifique de structure microcristalline caractérisée par une alternance de couches fibreuses de quartz cryptocristallin; deuxièmement, plus largement pour décrire une gamme de pierres précieuses qui correspondent à cette description, y compris des variétés translucides telles que l'agate, la cornaline, la chrysoprase, le jaspe et l'onyx, ainsi que certains spécimens opaques.