Il y a deux chambres principales :
* La Chambre des Ombres : C'est ici que vous affrontez le Pokémon Ombre pour la première fois. Il faut les combattre pour les purifier.
* La Chambre des Ténèbres : C'est la salle finale où vous affrontez le boss final, le chef des Pokémon Ombre. Il est accessible après avoir accompli certaines tâches et purifié plusieurs Pokémon Ombre.
L'emplacement exact dans l'installation Pokémon Ombre n'est pas spécifié dans le jeu, mais il se trouve généralement plus profondément dans l'installation une fois que vous avez progressé dans l'histoire.