En 2006, Moody quitte le groupe et est remplacé par Terry Balsamo. Evanescence a sorti son deuxième album studio, The Open Door (2006), qui a fait ses débuts au numéro un du classement Billboard 200 et a été certifié deux fois platine par la RIAA. L'album a donné naissance à trois singles à succès :"Call Me When You're Sober" , "Lithium" , et "Doux sacrifice" .
En 2009, le batteur Will Boyd et le bassiste Tim McCord quittent le groupe. Evanescence a fait une pause et Lee a enregistré un album solo, Aftermath. (2014).
En 2015, Evanescence retrouve Lee, Balsamo et le batteur Troy McLawhorn. Le groupe a sorti son troisième album studio, Evanescence (2011), qui a fait ses débuts au numéro un du classement Billboard 200 et a été certifié or par la RIAA. L'album a donné naissance à deux singles à succès :"What You Want" et "Mon cœur est brisé" .
En 2012, Evanescence sort son quatrième album studio, Synthesis (2017), qui présentait des arrangements orchestraux de leurs chansons classiques. L'album a fait ses débuts à la huitième place du classement Billboard 200.
En 2017, Balsamo quitte le groupe et est remplacé par Jen Majura. Evanescence a sorti son cinquième album studio, The Bitter Truth (2021), qui a fait ses débuts au numéro quatre du classement Billboard 200.
Evanescence est actuellement en tournée pour soutenir The Bitter Truth .