- Mangez, buvez et soyez en bonne santé :Le guide de la Harvard Medical School pour une alimentation saine (2001)
- Epidémiologie nutritionnelle, 3e édition (2013) (co-édité avec Meir Stampfer)
- Willett's Nutritional Epidemiology, deuxième édition (2018) (édité par Willett)
- The Salt Sugar Fat Fix :Comment les géants de l'alimentation nous ont accrochés (2020) (co-écrit avec Marion Nestlé)
En plus de ces livres, Walter Willett a publié des articles scientifiques, des critiques et des recommandations politiques dans diverses revues médicales et nutritionnelles.