* Prix BAFTA :
* Meilleure performance de divertissement léger pour "Blackadder" (1987)
* Meilleure performance de divertissement léger pour "The Thin Blue Line" (1996)
* BAFTA Fellowship (2013) - la plus haute distinction décernée par la British Academy of Film and Television Arts
* British Comedy Awards :
* Meilleur acteur de comédie pour "Blackadder" (1991, 1993)
* Meilleur acteur de comédie pour "The Thin Blue Line" (1995)
* Prix pour l'ensemble de sa carrière (2003)
* Autres récompenses :
* Rose d'Or de Montreux (1988) pour "Blackadder the Third"
* Rose d'Or de Montreux (1991) pour "Blackadder Goes Forth"
* Prix Laurence Olivier du meilleur acteur dans une nouvelle comédie pour "La Maison de Bernarda Alba" (1987)
Il ne s'agit pas d'une liste exhaustive, mais elle présente certaines des récompenses les plus remarquables qu'Atkinson a reçues. Il a également été nominé pour divers autres prix, notamment les Golden Globes et les Primetime Emmy Awards.