- MTV Europe Music Awards 2007 :Meilleur rock
- MTV Video Music Awards 2010 :Meilleure vidéo alternative ("Kings and Queens")
- MTV Video Music Awards 2011 :Meilleure vidéo rock ("Closer to the Edge")
- MTV Video Music Awards 2013 :Meilleure vidéo alternative ("Up in the Air")
- Billboard Music Awards 2014 :Meilleure chanson rock ("Up in the Air")
- iHeartRadio Music Awards 2015 :Meilleure chanson rock alternative de l'année ("Walk on Water")
- Alternative Press Music Awards 2017 :Meilleur groupe live
- Lo Nuestro Awards 2018 :Chanson pop/rock de l'année ("Rescue Me")
En plus de ces prix, 30 Seconds to Mars a également été nominé pour de nombreux autres prix, notamment les Grammy Awards et les Brit Awards.