Bien qu'il y ait eu des rumeurs et des discussions entre fans sur une suite potentielle, rien n'a été confirmé ou développé. La prémisse et la fin uniques du film laissent peu de place à une histoire de suivi traditionnelle, ce qui rend la perspective d'une suite difficile.
Cependant, le réalisateur du film, Spike Jonze, et le scénariste, Charlie Kaufman, ont tous deux créé d'autres projets à succès et acclamés, notamment :
* Spike Jonze : "Adaptation", "Elle", "Où sont les choses sauvages"
* Charlie Kaufman : "Eternal Sunshine of the Spotless Mind", "Synecdoche, New York", "Anomalisa"
Même si une suite à "Being John Malkovich" n'est peut-être pas en préparation, Jonze et Kaufman continuent de créer des films originaux et stimulants qui explorent la condition humaine de manière unique et imaginative.