Le jeu comporte deux flûtes :
* Flûte temporelle : Cette flûte sert à ralentir le temps, permettant ainsi de capturer des Pokémon plus facilement.
* Flûte spatiale : Cette flûte est utilisée pour se téléporter vers un emplacement différent dans la zone actuelle.
Il n'y a pas de troisième flûte dans le jeu. Si vous pensez à un autre objet ou mécanique, veuillez fournir plus de contexte.