• Concerto brandebourgeois n° 2 en fa majeur, BWV 1047 :ce concerto présente une partie de flûte importante dans les premier et troisième mouvements.
• Concerto brandebourgeois n° 4 en sol majeur, BWV 1049 :La flûte joue un rôle soliste dans le deuxième mouvement de ce concerto.
• Suite orchestrale n°2 en si mineur, BWV 1067 :La flûte est présente dans le mouvement « Badinerie » de cette suite.
• Sonate pour flûte en la majeur, BWV 1032 :Cette sonate est spécialement écrite pour la flûte et le clavecin ou le continuo.
• Sonate pour flûte et basse continue en mi mineur, BWV 1034 :Une autre sonate mettant en vedette la flûte, accompagnée d'un continuo.
• Partita pour flûte en la mineur, BWV 1013 :Cette partita se compose de plusieurs mouvements de danse écrits pour la flûte.
• Cantates :Bach a également inclus des parties de flûte dans certaines de ses cantates d'église, telles que "Jauchzet Gott in allen Landen", BWV 51, et "Ich armer Mensch, ich Sündenknecht", BWV 55.
Ce ne sont là que quelques exemples de compositions de Bach incluant de la musique écrite pour flûtes. Bach n’a pas écrit un concerto pour flûte exclusif en soi.