La chanson commence avec Gérard chantant la force et la résilience de sa mère, décrivant comment elle l'a élevé seul, lui et son frère Mikey, après le divorce de leurs parents. Il la remercie pour son amour et son soutien inconditionnels et pour lui avoir appris à être fort et indépendant.
Au fur et à mesure que la chanson avance, Gérard parle de ses sentiments de chagrin et de perte après le décès de sa mère. Il chante à quel point elle lui manque et combien il aurait souhaité pouvoir passer plus de temps avec elle. Il exprime également sa culpabilité de ne pas avoir pu la sauver de sa maladie.
Malgré la douleur et la tristesse, la chanson célèbre finalement la vie et l'amour de Donna Lee Way. Gérard chante comment elle sera toujours dans son cœur et comment son esprit continuera de le guider tout au long de sa vie.
Le clip de "Mama" présente des vidéos personnelles et des photographies de Gérard et Mikey avec leur mère, ainsi que des images de leur enfance. Il fournit une représentation visuelle du lien étroit entre Gerard et Donna et contribue à donner vie aux paroles de la chanson.
Dans l'ensemble, "Mama" est une chanson puissante et émouvante qui exprime l'amour et l'admiration profonds que Gerard Way avait pour sa mère. C'est une chanson sur le chagrin, la perte et le pouvoir durable de l'amour.