Voici ce qui se passe lorsque vous terminez le bâtiment Silph Co. dans ces jeux :
* Vous sauvez le Pokémon kidnappé : Le chef de la Team Rocket, Giovanni, a kidnappé des Pokémon et les utilise pour ses propres plans diaboliques. Vous devez vous frayer un chemin à travers le bâtiment pour les sauver.
* Vous battez Giovanni : Vous finirez par affronter Giovanni dans une bataille difficile. Si vous gagnez, vous libérerez le bâtiment et obtiendrez un objet spécial (Silph Scope), qui vous aidera à gérer les Pokémon de type Ghost.
* Vous contribuez à l'histoire : Terminer le bâtiment Silph Co. est un événement clé qui vous aide à progresser dans l'histoire et à découvrir davantage les plans de la Team Rocket.
Dans Pokémon Or et Argent, le "Bâtiment Silph Co." est absent . Il y a des lieux complètement différents et un arc d'histoire différent avec une nouvelle équipe méchante, la Team Rocket.