* Kryptonite : Ce minéral radioactif de la planète natale de Superman, Krypton, est sa faiblesse la plus célèbre. L'exposition à la kryptonite affaiblit Superman, le rendant malade et susceptible de se blesser. Différents types de kryptonite ont des effets différents, certains étant plus mortels que d’autres.
* Magie : Bien que Superman soit incroyablement fort, il s'est montré vulnérable à la magie. Des personnages dotés de capacités magiques ont pu blesser Superman, même s'il est par ailleurs invincible.
* Rayonnement du soleil rouge : Les pouvoirs de Superman sont alimentés par le soleil jaune de la Terre. L'exposition au rayonnement solaire rouge, comme celui de sa planète natale Krypton, l'affaiblit et finit par épuiser complètement ses pouvoirs.
* Certaines attaques psychologiques : Bien que Superman soit incroyablement résistant, il peut être vulnérable aux attaques psychologiques. Certains méchants ont réussi à exploiter ses émotions humaines et son sens de la moralité, le poussant à remettre en question ses actions et à l'affaiblir momentanément.
Il est important de se rappeler que les vulnérabilités de Superman ont été explorées et décrites différemment au fil des ans, selon l'écrivain et l'histoire racontée.