* 1567 : Après la mort de son mari, Lord Darnley, et son mariage avec le comte de Bothwell, Mary fut forcée d'abdiquer le trône écossais et emprisonnée au château de Lochleven .
* 1568 : Elle s'échappa du château de Lochleven, mais fut vaincue à la bataille de Langside et s'enfuit en Angleterre, où elle fut emprisonnée pour le reste de sa vie. Elle a d'abord été détenue au château de Carlisle.
* 1568-1572 : Elle a été transférée au château de Bolton puis au château de Sheffield.
* 1572-1587 : Mary a été transférée au château de Tutbury, au manoir Wingfield, à Coventry, à Chatsworth House et enfin au château de Fotheringhay, où elle a été jugée et exécutée en 1587.
Il est important de noter qu'elle n'a pas toujours été gardée dans des conditions difficiles. Certains de ses emprisonnements étaient plus confortables que d'autres, selon le lieu et le climat politique. Cependant, elle a toujours été sous haute surveillance et n’a jamais retrouvé sa liberté.