Au fur et à mesure que l'histoire avance, Fiona apprend que sa vraie beauté ne réside pas dans son apparence physique mais dans sa gentillesse, son amour et ses qualités intérieures. Elle choisit de rester sous sa forme d'ogre, embrassant son vrai moi quelles que soient les normes sociétales. Les préjugés initiaux de Shrek contre les humains et les ogres sont également remis en question, montrant que la vraie beauté va au-delà des attributs physiques et des notions préconçues.
Le film renforce le message selon lequel la beauté intérieure et la capacité d’aimer et d’être aimé comptent plus que la beauté physique superficielle. La relation entre Shrek et Fiona souligne cette idée alors qu'ils trouvent l'amour et l'acceptation malgré leurs différences physiques.