Constitutions de Clarendon : Henri II a publié un ensemble de lois connues sous le nom de Constitutions de Clarendon en 1164. Ces lois visaient à limiter le pouvoir et les privilèges de l'Église d'Angleterre, notamment en ce qui concerne la nomination des évêques et la juridiction sur le clergé accusé de crimes. Becket, en tant qu'archevêque de Cantorbéry, s'est opposé aux Constitutions comme une atteinte à l'autonomie de l'Église.
Immunité ecclésiastique : Henri II souhaite affirmer son contrôle sur le clergé et le placer sous la juridiction des cours royales. Becket, quant à lui, croyait que le clergé ne devrait être soumis qu'aux tribunaux ecclésiastiques, plaidant pour le droit de l'Église à gouverner ses propres affaires.
Nomination des évêques : Henri II voulait avoir son mot à dire dans la nomination des évêques, s'assurant qu'ils lui étaient fidèles et soutenaient sa politique. Becket insistait sur le fait que la sélection des évêques devait être basée uniquement sur le mérite religieux, sans ingérence royale.
Conflit de compétence : Le conflit s'est intensifié lorsqu'un commis nommé Philippe de Brois a été accusé d'un crime et revendiqué à la fois par les cours royales et par la cour ecclésiastique. Becket a refusé de remettre le greffier à la cour royale, arguant que cela violait la juridiction de l'Église.
Le désaccord entre Henri II et Becket symbolisait une lutte plus large entre la monarchie et l’Église pour le contrôle et l’autorité. Le conflit culmine avec l'assassinat de Thomas Becket dans la cathédrale de Cantorbéry en 1170 par des chevaliers fidèles à Henri II. Le meurtre de Becket a provoqué une réaction violente importante et a finalement conduit Henri II à faire des concessions et à réaffirmer les privilèges et l'indépendance de l'Église.