Qu'est-ce que l'indice de Jacobsen ?

L'indice de Jacobsen d'un arbre phylogénétique est une mesure de sa ramification, ou du degré auquel l'arbre contient de courtes branches internes. Elle est définie comme le rapport entre la longueur totale de l'arbre (la somme des longueurs de toutes les branches de l'arbre) et la longueur minimale possible de l'arbre, qui est la longueur d'un arbre avec le même nombre de taxons et sans branches internes ( tous les taxons sont connectés directement à la racine).

Un indice de Jacobsen élevé indique un arbre avec de nombreuses branches internes courtes, ce qui peut être le résultat d'une radiation rapide des taxons ou d'un taux élevé d'évolution des caractères. Un indice de Jacobsen faible indique un arbre avec peu de branches internes courtes, ce qui peut être le résultat d'une lente radiation des taxons ou d'un faible taux d'évolution des caractères.

L'indice de Jacobsen est souvent utilisé pour comparer la ramification relative de différents arbres phylogénétiques et peut être utilisé pour évaluer l'ajustement de différents modèles évolutifs à un ensemble de données donné.