* L'illusion de Dieu (2006)
* L'aumônier du diable (2011)
* Jésus :la biographie non autorisée (2015)
* L'athée réticent :un roman de découverte et de rétablissement (2020)
Non-fiction
* Terreur impie :la vérité derrière l'État islamique et son ambition mondiale (2016)
* Nous devons parler de Dieu :guide de l'âme d'un neuroscientifique (2019)
* Pourquoi les gens croient en Dieu :un neuroscientifique explore la biologie de la foi religieuse (2022)
Histoires courtes
* "Le Dernier Miracle" (2014)
* "Le jour où les anges sont tombés" (2015)
* "L'homme qui rencontra Dieu" (2016)
Essais
* « La science peut-elle expliquer la religion ? (2017)
* « L'avenir de la religion à l'ère laïque » (2018)
* "Pourquoi je crois en Dieu" (2019)
Autobiographie
* Le garçon qui parlait à Dieu :un mémoire (2022)