Le roman est écrit du point de vue de Bruno, un garçon allemand de neuf ans qui ignore la véritable nature du travail de son père et les atrocités commises dans le camp de concentration adjacent à leur domicile. À travers les yeux de Bruno, les lecteurs sont témoins du contraste saisissant entre la vie privilégiée qu'il mène et les dures réalités auxquelles sont confrontés Shmuel et les autres prisonniers du camp.
La représentation des personnages par Boyne met l'accent sur les effets destructeurs de la guerre et des préjugés sur les individus et la société. La transformation de Bruno d'un enfant naïf à quelqu'un qui commence à remettre en question le monde qui l'entoure met en évidence l'importance de l'éducation et de l'empathie dans la lutte contre la haine et l'intolérance. L'amitié entre Bruno et Shmuel, malgré les barrières imposées par leurs circonstances, constitue un symbole puissant de la résilience de l'esprit humain, même face à des souffrances inimaginables.
De plus, l'utilisation par Boyne d'un langage simple et d'une narration directe permet à la gravité des événements de résonner profondément auprès des lecteurs, jeunes et moins jeunes. En présentant les horreurs de l'Holocauste à travers le point de vue d'un enfant, il transmet l'impact profond de ces événements sans recourir à des descriptions graphiques. Cette approche souligne le message universel selon lequel la guerre et l’intolérance sont des forces dévastatrices auxquelles il faut s’opposer et éliminer.
Dans l'ensemble, "Le garçon au pyjama rayé" constitue un rappel poignant des conséquences de préjugés et de haine incontrôlés, et plaide avec force en faveur de la paix, de la tolérance et de la compréhension entre des personnes d'horizons différents.