Ce film met en vedette Richard Gere dans le rôle de Dennis Peck, un flic corrompu qui a une liaison avec la femme de son partenaire Ray Avila (Andy Garcia). Lorsque Ray découvre l'affaire, il est furieux et confronte Dennis. Les deux hommes se battent et Ray est tué. Dennis dissimule le crime et donne l'impression que Ray s'est suicidé.
Dennis continue de travailler comme policier, mais il est hanté par la culpabilité de ce qu'il a fait. Il finit par se confesser à un prêtre, et celui-ci l'encourage à se rendre. Dennis le fait et il est envoyé en prison.
Affaires internes est un drame policier classique qui explore les thèmes de la corruption, de la culpabilité et de la rédemption. C'est un film bien réalisé avec de solides performances de Gere et Garcia.